Carmen de Santistevan y Avilés sinh ngày 3 tháng 5 năm 1810 tại Daule, sau đó là một phần của Đế quốc Tây Ban Nha.[1] Bà là con gái của Gabriel de Santistevan y Olvera và người vợ đầu tiên của ông, Francisca de Avilés y Castro, người mà ông có một cô con gái khác tên là Francisca.[2] Sau khi cha bà trở thành người góa vợ, ông đi đến Buenos Aires, tái hôn và có chín đứa con, không bao giờ quay lại Ecuador.[2]

Bà là hậu duệ của dòng họ Komnenos, một triều đại quan trọng của Đế quốc Byzantine.[3]